Ingénieur / Ingénieure d'application informatique

Rattaché/e directement à la Direction des Services Informatiques d'Université Côte d'Azur, et dans le cadre de vie exceptionnel du cœur de Nice et de la technopole internationale de Sophia Antipolis, à proximité des transports et de nombreux équipements sportifs, vous serez responsable technique de l'EquipEx+4D-OMICS, en lien direct avec son responsable scientifique et les différents laboratoires concernés. L'EquipEx+ 4D-OMICS rassemble les équipements et ressources nécessaires à la réalisation de programmes en biologie quantitative. Il fournit aux laboratoires partenaires un stockage massif de données et des moyens de calculs performants. Le programme est mené conjointement par deux grandes universités de recherche, Université Côte d'Azur et Aix-Marseille Université (AMU), en partenariat avec deux établissements de santé de premier plan, Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM) et Institut Paoli-Calmettes (IPC), une école d'ingénieurs (Eurecom), le CNRS, l'INSERM et l'INRAE. Votre mission principale sera d'accompagner les équipes de Recherche dans l'usage des services mis en place par les équipes techniques d'Aix-Marseille Université (ex: machines virtuelles, calcul), d'Eurecom(archivage) et d'Université Côte d'Azur (stockage, calcul). Vous devrez travailler en étroite collaboration avec l'ensemble des partenaires pour mettre en place un accès à ces services et serez en charge de l'administration des services de stockage hébergés dans l'antenne Datacenter Sud de Nice.

Vos missions :

Assurer l'administration système et réseau de l'infrastructure mise en place dans le cadre du projet :
Administration des moyens de stockage partagés entre plusieurs laboratoires de l'université.
Configuration de l'environnement de travail et exécution des codes / workflows sur des serveurs distants type cluster HPC.
Mise en œuvre des outils et services liés à l'exploitation en lien avec les différents acteurs
Suivi quotidien des infrastructures et de leur bon fonctionnement
Accompagner les utilisateurs dans l'usage des outils mis en place (stockage, archivage, calcul,..) sur Nice, Sophia et Marseille :
Assistance aux membres des laboratoires dans leurs activités sur outils informatiques :développement et exécution de code, installation / configuration des logiciels, stockage des données, utilisation de serveurs distants,...
Organisation de formations si besoin et rédaction des documentations correspondantes
Pilotage de l'évolution du Projet
Prévoir les évolutions techniques et le renouvellement du matériel en fonction des besoins et en adéquation avec les nouvelles technologies
Assurer une action de veille technologique active sur les architectures et les outils associés en vue du renouvellement et de l'amélioration de la plateforme
Participer activement à la communication faite autour du Projet et des activités associées

Profil recherché :

Connaissances :
Connaissances sur le management des données ; des outils d'administration, d'audit et d'analyse des systèmes
Connaissance de l'anglais technique, d'animation de réunion et de formation (écrit et oral)

Compétences techniques :
Maîtrise de R et python indispensable
La maîtrise du déploiement de pipelines bio-informatiques (ex: Nextflow) serait un plus
Outils : maitrise des outils de type notebooks type Jupyter, Conda, Docker, Singularity...
Une expérience dans l'exécution de code sur carte GPU est nécessaire
La connaissance du deep learning, tensorflow ou pytorch serait un plus
Compétences en administration systèmes/réseaux (Linux serait un plus)
Compétences en virtualisation des systèmes et des logiciels associés
Compétences sur les espaces de stockage et les technologies associées

Savoir être :
Capacité à travailler en autonomie sur des projets spécifiques ; à travailler en équipe afin d'assurer les missions quotidiennes du service