informations générales
Seine-Saint-Denis
CDI
Le bioinformaticien que nous recherchons possède une grande expertise en biologie computationnelle, en analyse de données et en outils logiciels permettant d'interpréter des données biologiques complexes. Son rôle consiste à collaborer avec des scientifiques, des ingénieurs, des techniciens et des chercheurs afin de développer des pipelines, d'analyser des ensembles de données à haut débit et de générer des connaissances qui favorisent les découvertes scientifiques et l'innovation.
En travaillant chez Neoplants, le / la bioinformaticien.ne a l'opportunité unique de participer à des recherches de pointe et à des projets ambitieux qui peuvent littéralement changer le monde, au sein d'une équipe collaborative, interdisciplinaire et très engagée.
Mission principale (liste non exhaustive) :
- Concevoir, mettre en œuvre, optimiser et maintenir des flux de travail et des pipelines bioinformatiques pour les données à haut débit et analyser des ensembles de données à grande échelle.
- Analyser et intégrer des ensembles de données multi-omiques pour soutenir la R&D, le développement de produits et la conception expérimentale.
- Prototyper et tester rapidement des approches computationnelles pour relever de nouveaux défis scientifiques.
- Collaborer avec des équipes interfonctionnelles pour traduire les données brutes en connaissances biologiques et en outils d'aide à la décision.
- Évaluer et mettre en œuvre les nouveaux outils, méthodes et technologies bioinformatiques.
- Documenter les flux de travail et communiquer clairement les résultats aux parties prenantes techniques et non techniques.
- Contribuer à la propriété intellectuelle, aux publications, aux présentations à mesure que l'entreprise se développe et aux demandes de subventions, le cas échéant.
- Se tenir au courant des nouveaux outils, méthodes et technologies bioinformatiques.
Expérience requise :
- Maîtrise ou doctorat en bio-informatique, biologie computationnelle, informatique, statistiques ou dans un domaine connexe (ou expérience professionnelle équivalente).
- Solides compétences en programmation dans des langages tels que Python, R ou Perl.
- Maîtrise des outils, bases de données et plateformes bioinformatiques (par exemple, NCBI, Ensembl, UCSC Genome Browser, BLAST, GATK).
- Expérience avec les données de séquençage à haut débit (par exemple, RNA-seq, WGS, WES, scRNA-seq).
- Maîtrise du machine learning, de la modélisation statistique ou de la visualisation de données est un plus.
- Solides compétences en résolution de problèmes et capacité à travailler de manière autonome et collaborative.
- Excellentes compétences en communication écrite et orale.
- Rigueur scientifique extrême et souci du détail.
- Capacité à travailler de manière autonome avec peu ou pas de supervision.
- Esprit d'équipe, bonnes compétences interpersonnelles et communicationnelles.
- Maîtrise de l'anglais (oral et écrit)
Atouts supplémentaires :
- Expérience dans les environnements de cloud computing (AWS, GCP ou Azure).
- Connaissance des systèmes de gestion des flux de travail (par exemple, Snakemake, Nextflow, CWL).
- Formation en biologie moléculaire, génétique ou recherche biomédicale.
- Connaissance du contrôle de version (Git/GitHub) et des pratiques de codage collaboratif.
En savoir plus sur cette annonce sur le site de notre partenaireEn travaillant chez Neoplants, le / la bioinformaticien.ne a l'opportunité unique de participer à des recherches de pointe et à des projets ambitieux qui peuvent littéralement changer le monde, au sein d'une équipe collaborative, interdisciplinaire et très engagée.
Mission principale (liste non exhaustive) :
- Concevoir, mettre en œuvre, optimiser et maintenir des flux de travail et des pipelines bioinformatiques pour les données à haut débit et analyser des ensembles de données à grande échelle.
- Analyser et intégrer des ensembles de données multi-omiques pour soutenir la R&D, le développement de produits et la conception expérimentale.
- Prototyper et tester rapidement des approches computationnelles pour relever de nouveaux défis scientifiques.
- Collaborer avec des équipes interfonctionnelles pour traduire les données brutes en connaissances biologiques et en outils d'aide à la décision.
- Évaluer et mettre en œuvre les nouveaux outils, méthodes et technologies bioinformatiques.
- Documenter les flux de travail et communiquer clairement les résultats aux parties prenantes techniques et non techniques.
- Contribuer à la propriété intellectuelle, aux publications, aux présentations à mesure que l'entreprise se développe et aux demandes de subventions, le cas échéant.
- Se tenir au courant des nouveaux outils, méthodes et technologies bioinformatiques.
Expérience requise :
- Maîtrise ou doctorat en bio-informatique, biologie computationnelle, informatique, statistiques ou dans un domaine connexe (ou expérience professionnelle équivalente).
- Solides compétences en programmation dans des langages tels que Python, R ou Perl.
- Maîtrise des outils, bases de données et plateformes bioinformatiques (par exemple, NCBI, Ensembl, UCSC Genome Browser, BLAST, GATK).
- Expérience avec les données de séquençage à haut débit (par exemple, RNA-seq, WGS, WES, scRNA-seq).
- Maîtrise du machine learning, de la modélisation statistique ou de la visualisation de données est un plus.
- Solides compétences en résolution de problèmes et capacité à travailler de manière autonome et collaborative.
- Excellentes compétences en communication écrite et orale.
- Rigueur scientifique extrême et souci du détail.
- Capacité à travailler de manière autonome avec peu ou pas de supervision.
- Esprit d'équipe, bonnes compétences interpersonnelles et communicationnelles.
- Maîtrise de l'anglais (oral et écrit)
Atouts supplémentaires :
- Expérience dans les environnements de cloud computing (AWS, GCP ou Azure).
- Connaissance des systèmes de gestion des flux de travail (par exemple, Snakemake, Nextflow, CWL).
- Formation en biologie moléculaire, génétique ou recherche biomédicale.
- Connaissance du contrôle de version (Git/GitHub) et des pratiques de codage collaboratif.
